Caracterizamos el ecosistema vaginal durante infecciones comunes del tracto genital femenino, como candidiasis vulvovaginal (CVV, n = 18) e infección por Chlamydia trachomatis (CT, n = 20), reclutando sanos (HC, n = 21) y afectados por vaginosis bacteriana (VB, n = 20) mujeres como referencias de eubiosis y disbiosis. Se estudiaron los perfiles del microbioma vaginal y del metaboloma en 79 mujeres en edad reproductiva, mediante secuenciación de próxima generación y espectroscopia de resonancia magnética nuclear basada en protones.

El género Lactobacillus se redujo profundamente en todas las infecciones genitales aquí consideradas, y el análisis a nivel de especie reveló que el microbioma vaginal sano estaba dominado por L. crispatus . En el cambio de HC a CT, VVC y BV, L. crispatusfue reemplazado progresivamente por L. iners . La infección por CT y VVC, así como la condición de VB, se caracterizaron principalmente por géneros anaerobios, por ejemplo,  Gardnerella,  Prevotella,  Megasphaera,  Roseburia  y  Atopobium. Los cambios en las comunidades bacterianas que ocurren durante las infecciones genitales resultaron en alteraciones significativas en la composición de los metabolitos vaginales, siendo la disminución de lactato un marcador común de todas las condiciones patológicas. En conclusión, de acuerdo con el análisis taxonómico y metabolómico, encontramos que cada una de las cuatro condiciones se caracteriza por una huella dactilar de microbioma / metaboloma vaginal peculiar.

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https://www.nature.com/articles/s41598-019-50410-x